音乐学院创建于1986年，1992年被原国家教委确定为“全国高等师范院校教育改革试点”单位，1995年音乐学专业被评为江苏省教学改革试点专业，2007年被教育部确定为全国普通高等学校音乐学(教师教育)本科专业课程试点单位。现有教学及管理人员53人，其中专职教师44人，现职人员中有教授3人，副教授23人，讲师19人，博士和在读博士研究生7人，硕士研究生30人，专业教师分别来自中央音乐学院、中国音乐学院、南京艺术学院、西安音乐学院、沈阳音乐学院、东北师范大学、白俄罗斯国立文化艺术大学、南京师范大学等高校，有良

音乐学院自2001年招收本科生以来，经过二十年的不断发展，目前已成为省内较有影响的音乐人才培养基地。有音乐学(师范)、音乐表演(含声乐、钢琴、器乐、现代音乐等方向)等本科专业和方向，现有在校生550多人。音乐与舞蹈学为南京市重点学科，音乐学为校级重点建设专业,传统音乐是江苏省首届非物质文化遗产研究基地的主要研究方向。

南京艺术学院音乐学院是我国办学历史最悠久的高等音乐教育机构之一。1921年，南艺前身“上海美专”为艺术教师进修而专设为期6周的暑假短期培训班，编制分绘画、音乐两组，标志着音乐人才的培养正式进入“上海美专”的教学体系。1923年，音乐学科独立建制，设立音乐系，首任主任刘质平。1952年和山东大学艺术系音乐科合并成立华东艺术专科学校音乐系。1958年更名为南京艺术学院音乐系。1999年定名为南京艺术学院音乐学院。