福建师范大学音乐学院的历史可以追溯到1938年的华南女子文理学院。[注]1952年8月福建师范学院正式创建音乐专修科，1958年系所调整后，并入艺术系;1985年1月撤消艺术系，成立音乐系;1993年12月，并入艺术学院。2003年12月，成立音乐学院。

南京师范大学音乐学院拥有“音乐与舞蹈学”一级学科博士与硕士学位授权点、“音乐与舞蹈学”一级学科博士后科研流动站，形成了从本科教育到博士后流动站完整而成熟的人才培养体系。其中音乐学学科是国家“211工程”重点建设学科、江苏省“九五”及“十五”重点学科、江苏省高等学校品牌专业。同时，音乐学院是教育部“国家体育与艺术师资培养培训基地”。